Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TDP1Q9NUW8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TDP1Q9NUW8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TDP1Q9NUW8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TDP1Q9NUW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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TDP1Q9NUW8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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