Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN4Q9NQP4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms