Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FANCFQ9NPI8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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