Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NRDE2Q9H7Z3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms