Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM38AQ9H6F2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms