Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms