Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCSER1Q9C0I3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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