Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSTA-202ENST00000479204 821 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUZ12P1-207ENST00000583950 741 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01697-206ENST00000616647 544 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC236972.3-202ENST00000620734 1222 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms