Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms