Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms