Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP2Q9BX26 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2Q9BX26 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms