Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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