Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms