Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SPOCK3Q9BQ16 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPOCK3Q9BQ16 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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