Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms