Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms