Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms