Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms