Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SHDQ96IW2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms