Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms