Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CPNE2Q96FN4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE2Q96FN4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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