Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMNTD2Q8IXW0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms