Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRCQ7RTU9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms