Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUSD1Q6UWL2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms