Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms