Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms