Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF9Q5VWM5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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