Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA8Q53HL2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms