Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD4L6Q3SYB3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXD4L6Q3SYB3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms