Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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