Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms