Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TWISTNBQ3B726 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms