Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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