Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USF2Q15853 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USF2Q15853 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USF2Q15853 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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