Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA6Q15825 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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