Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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