Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PDCD1Q15116 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PDCD1Q15116 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PDCD1Q15116 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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PDCD1Q15116 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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