Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms