Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
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