Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC3Q14574 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC3Q14574 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms