Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL4A6Q14031 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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COL4A6Q14031 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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COL4A6Q14031 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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