Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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CKAP5Q14008 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CKAP5Q14008 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CKAP5Q14008 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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