Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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