Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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