Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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