Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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