Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXO1Q12778 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXO1Q12778 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXO1Q12778 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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FOXO1Q12778 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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