Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms