Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LOXL1Q08397 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms