Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms